产品特点:
研究真核基因的基础的工作之一就是确定其转录终止位点,目前通用的方法是5′-RACE法,RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)是Frohman发明的、通过PCR快速克隆cDNA末端的技术,它在不建立cDNA文库的前提下,利用已知cDNA序列设计引物,通过往两端延伸和扩增获得其5′-端序列。本试剂盒就是根据5′-RACE原理而开发,它具有下列特点:
1. 即开即用,客户不需要单独准备各种材料。
2. 反应条件经过精心优化,包括使用无RNase H活性的MMLV和优化的引物。
低温运输、-20℃保存、有效期一年。
1. 变性模板RNA:将1 μg mRNA或5 μg 总RNA加入到一个RNase-free的PCR管中,补RNase-Free水到9 μL,65℃保温5分钟后短暂离心,立即放冰上待用。如果RNA浓度偏低,体积超过9 μL,可以使用本公司的核酸浓缩剂(需另购,产品编号为110801-30)浓缩到所需的体积。
2. 设置RT反应(用户可以根据需要设阴性对照):在上步的含变性后的RNA模板的PCR管
3. 37℃保温60分钟, 42℃保温30分钟, 50℃保温10分钟,75℃保温10分钟使逆转录酶变性。
4. 短暂离心5秒后待用。
5. 在PCR管中加入40 μL微量核酸沉淀剂(本产品含不溶的核酸助沉剂,用前需要充分摇匀再取用),震荡混匀。
6. 室温12000 rpm离心15分钟,小心吸弃上清。
7. 加入1mL 自备75%乙醇,室温12000 rpm离心5分钟,小心吸弃上清。
8. 短暂离心数秒,小心吸弃残留液体后,稍微晾干后加入10 μL RNase-free水,充分吹打溶解,得到cDNA溶液。注意:为保证加尾效率,溶解cDNA的RNase-free水不要超过10 μL。
9. 加尾反应:在10 μL cDNA溶液中加10 μL 2×TdT Buffer(含dATP)和1 μL TdT酶,轻柔吹打混匀。
10. 37℃保温15分钟进行加尾反应,然后75℃保温3分钟灭活末端转移酶。
11. 加入0.5 mL RNase-free水稀释加尾反应体系。此稀释液将作为PCR的模板。
12. 轮PCR:用不同量的稀释后的加尾反应液设置PCR反应
13. 按下列条件进行 PCR(注:应根据实际情况选择适当的退火温度)。
第 1 次循环:94℃ 5 分,48-52℃ 2 分,72℃ 4 分
第 2-30 次循环:94℃ 40 秒,52-60℃ 1 分,72℃ 3 分
延伸:72℃ 15 分
14. 取 10-20μL PCR 产物进行琼脂糖电泳电泳检查 PCR 结果,如果一条清晰的条
带,则可以不做后续的第二轮 PCR,而直接进行 DNA 测序或 TA 克隆。
15. 第二轮 PCR:如果轮 PCR 没有一条清晰的条,则带从 4 管 PCR 产物中各
取 1μL 分别加入到 20 μL RNase-free 水中进行稀释,然后各取 1 μL 分别作
为 4 管第二轮 PCR 的模板
16. 按下列条件进行 PCR:第 1-30 次循环(94℃ 40 秒,52-60℃ 1 分,72℃ 3
分),延伸:72℃ 15 分
17. 取 10-20μL 第二轮 PCR 产物进行琼脂糖电泳,一般都会有一个样品有清晰的
条带出现,则可以直接进行 DNA 测序或 TA 克隆。