本产品是百奥莱博柱式植物RNAOUT(BTN71203)的大提升级产品,它结合了植物RNAOUT 的高效性(其效果在近五十多种各类植物中得到验证,植物名单见植物RNAOUT 产品介绍的附录)和天泽基因柱式纯化系列产品的快捷性。该产品特点如下:
1. 样品处理量大,可以处理5g 的植物材料。
2. 操作简单快速,处理一个样品只需要约二十分钟。
3. RNA 纯度更高,平均OD260/280 一般都在2.0 左右,能够有效去除大多数植物中的多糖污染。
4. 产量高(具体根据材料不同而不同)。
5. 得到的RNA 可直接用于RT-PCR、Northern 杂交、cDNA 合成等实验。
常温运输,4℃保存,有效期一年。
使用方法:
1. 估算组织细胞的用量。每次大量提取一般需要3-5g 植物叶片、或1-3g植物种子、或5-10g 植物果实。
2. 先将新鲜植物组织剪切成小块(保存在RNALOCKER中的植物组织需用纸吸去RNALOCKER 液体后再剪切成小块),放入50mL 塑料离心管中,加入20mL 溶液A,然后用匀浆器匀浆。匀浆时会产生泡沫,但不影响提取效果。也可以使用液氮砚磨法破碎植物组织,但为避免氧化,砚磨时必须将组织浸泡在溶液A 中进行,不能只在液氮中砚磨,然后再将砚磨物转移至干净的50 mL 塑料离心管中。注意:溶解溶液A 沉淀。溶液A 在4℃放置后可能会产生沉淀,使用前必须放在65℃水浴使沉淀彻底溶解并充分摇匀后再取用。
3. 在离心管中加入5 mL 的溶液B 和5 mL 自备氯仿,在振荡器上充分振荡1-3 分钟,此时溶液呈均匀的乳浊状。振荡器振荡时必须使管底溶液震荡起来。
4. 室温12000-15000 g 离心3-5 分钟,水相和有机相之间将有较厚的细胞破碎物。
5. 将上清液转移到另一干净的50mL 塑料离心管中。下层有机相和中间层含有DNA、蛋白质和其他杂质,避免触及或吸取。留下少量上清液不取。
6. 加入等体积的溶液C,充分颠倒混匀。
7. 将一半的溶液转移到大提离心吸附柱中,13000-15000 g 室温离心3-5分钟,弃穿透液。
8. 将剩下的一半溶液转移到同一大提离心吸附柱中, 13000-15000 g 室温离心3-5 分钟,弃穿透液。
9. 加10 mL 通用洗柱液,室温离心3-5 分钟,弃穿透液。
10. 重复上步,加10 mL 通用洗柱液,室温离心3-5 分钟,弃穿透液。
11. 室温离心1-3 分钟。此步十分重要,否则残留的乙醇会影响RNA 的使用。
12. 将大提离心吸附柱转移到一个自备的RNase-free 收集管中,加入0.5 mLRNA 洗脱液,室温放置1-2 分钟。
13. 13000-15000 g 室温离心半分钟,离心管中溶液即为RNA 样品。
14. 再加入0.5 mL RNA 洗脱液,重复上面两步。
15. 将两次洗脱得到的RNA 立即使用或存放于-80℃待用
16. RNA 完整性的电泳检测:如果需要做Northern 杂交,强烈建议用户使用甲醛变性胶进行RNA 电泳,因为非变性胶不能分离所有的RNA 分子(BioTechniques,28:414,2000)。
17. RNA 产量产率测定:将5-10 μL RNA 溶于TE 缓冲液中(pH7.5-8.2 之间)检测其在OD260 的光吸收。通过光吸收可以得出RNA 浓度(1 OD260的RNA=40 μg/mL),进而计算出RNA 的产量(浓度X 体积)和产率(RNA产量/组织用量)。
18. RNA 纯度测定:无污染的总RNA 的OD260/OD280 一般在1.8-2.1 之间(具体数值与其碱基组成和溶液成分等多种因素有关),高于此范围则分别表示样品可能有蛋白质污染,但一般不影响RT-PCR 等反应。