产品及特点:

构建cDNA文库、蛋白质的体外翻译和RT-PCR方法检测稀有的mRNA等研究常常需要从总RNA中分离mRNA,mRNA只占总RNA的1%左右,但由于带poly(A)尾巴,所以可以通过与Oligo(dT)纤维素的亲和结合而与其他RNA(如rRNA、tRNA等)分离开。本产品专门用于从动物组织中提取mRNA,它具有下列特点:

1. 一站式,由柱式动物RNA提取试剂和mRNA提取试剂两个产品整合而成,即开即用,非常方便。

2. 可以处理50-100 mg的动物组织,能得到约10-15 ug总RNA,从中可得0.1-0.5 ug 左右的mRNA。

3. Oligo(dT)纤维素吸附能力强,每克可以吸附50-80 OD的mRNA,相当于2000-3000 ug mRNA。

4. mRNA提取过程操作简单,只需要离心就可以完成,免去了常规的灌柱、洗柱等繁琐操作。

5. 得到的mRNA可以直接用于构建cDNA文库、蛋白质的体外翻译和RT-PCR。


常温运输, Oligo(dT)纤维素-20℃保存,RNA洗液4℃保存,其余产品可以室温放置。本产品有效期一年。


使用方法:

一:用柱式动物RNAout提取总RNA

下面的操作步骤是针对在1.5 mL塑料离心管中进行的微量提取的,如果处理样品量大,请按比例增加各成份的用量并使用大的离心管和离心机。

1. 新鲜配制裂解液。将溶液A和溶液B按1:1的比例混合,然后根据组织细胞类型的不同分为下面及种情况使用。注意:溶液A和溶液B混合后必须立即使用,不要放置,否则会产生沉淀。

a) 对贴壁细胞:吸尽培养液,在每10平方厘米细胞中加入1 mL新鲜配制的裂解液,用枪轻柔吹打数次,确保细胞全部裂解。

b) 对悬浮细胞:离心收集细胞,吸尽液体,在每1-5×106悬浮细胞中加入1 mL新鲜配制的裂解液,用枪轻柔吹打数次,确保细胞全部裂解。如果是fibroblasts或carcinoma cell,1 mL新鲜配制的裂解液的细胞使用量不要超过1×106个细胞。

c) 对新鲜组织:先将剪切成小块新鲜组织或液氮保存的组织放入10 mL或15 mL塑料离心管中,每50-100 mg组织加1 mL新鲜配制的裂解液,用匀浆器匀浆30秒左右。对肝、脾、胰、肾等细胞分裂十分旺盛的组织(细胞中含大量正在复制的DNA),建议组织的使用量不要超过50 mg/ mL裂解液,否则十分容易产生DNA污染。

d) 对RNALOCKER保存组织:先用纸吸去RNALOCKER液体后再剪切成小块,其余操作同新鲜组织的处理。

2. 将裂解物转移至一个干净的1.5 mL塑料离心管中,然后加入0.2倍体积的自备氯仿(1 mL裂解物需0.2 ml氯仿),振荡器上充分振荡混均30秒。

3. 12000-15000 g室温离心3-5分钟。

4. 将上清液(约0.6-0.8 mL)转移到离心吸附柱中。注意:离心后下层有机相和中间层含有DNA和蛋白质,避免触及,否则将产生蛋白质和DNA污染。为保险起见,可以留下100 uL上清液不取。同时吸取上清时缓慢进行,否则容易吸出交界面的不可见的丝状DNA。

5. 13000-15000 g室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。

6. 加0.5 mL通用洗柱液到离心吸附柱中,室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。

7. 再加0.5 mL通用洗柱液到离心吸附柱中,室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。

8. 室温离心半分钟。此步十分重要,否则残留的通用洗柱液会影响RNA的使用。

9. 将离心吸附柱转移到一自备的RNase-free收集管中,加入50 uL RNA洗脱液。

10. 室温离心半分钟,离心管中溶液即为RNA样品,可以立即使用或存放于-80℃待用。

11. RNA完整性的电泳检测:如果需要做Northern杂交,强烈建议用户使用甲醛变性胶进行RNA电泳,因为非变性胶不能分离所有的RNA分子(BioTechniques,28:414,2000)。

12. RNA产量产率测定:将5-10 μL RNA溶于TE缓冲液中(pH7.5-8.2之间)检测其在OD260的光吸收。通过光吸收可以得出RNA浓度(1 OD260的RNA=40 μg/mL),进而计算出RNA的产量(浓度X体积)和产率(RNA产量/组织用量)。

13. RNA纯度测定:无污染的总RNA的OD260/OD280一般在1.8-2.1之间(具体数值与其碱基组成和溶液成分等多种因素有关),高于此范围则分别表示样品可能有蛋白质污染,但一般不影响RT-PCR等反应。

二:从总RNA中提取mRNA

本产品提供本产品提供25 mg Oligo(dT)纤维素,每克Oligo(dT)纤维素能够结合50-80 OD的mRNA。

1. 在一个1.5 mL塑料离心管中称取1 mg Oligo (dT)纤维素。将0.5 mL结合液加入到一管装有1 mg Oligo (dT)纤维素的离心管中,混匀后室温放置5分钟。也可以将250 uL 结合液加入到装有25 mg Oligo(dT)纤维素的离心管中,每次取10 uL(相当于1 mg Oligo (dT)纤维素)与0.5 mL结合液混匀,室温放置5分钟。剩余部分放-80℃保存。

2. 200-2000 g离心30秒,小心吸弃上清后留Oligo (dT)纤维素沉淀待用。

3. 将在节中提取的两管相同的总RNA(每个样品用50 uL洗脱)混合在一起得到总RNA 100 uL,65℃加热 5分钟。

4. 加入等体积的结合液,混匀后冷却到室温后,全部转移到装有Oligo(dT)纤维素的离心管中,

5. 混匀后室温放置5分钟,期间颠倒混匀数次。

6. 4℃ 200-2000g 离心5分钟,小心将上清转移到一个离心管中。此上清液是去除了mRNA的总RNA。冰上放置待用。

7. 加入0.5 mL结合液,混匀后4℃ 200-2000g 离心5分钟,小心弃上清。

8. 重复上步2-4次。

9. 加入50 uL RNA洗脱液,混匀后4℃ 200-2000g 离心5分钟,小心收集上清(mRNA)。

10. 重复上步1-3次。

11. 将各次收集的mRNA混合。

三:用微量核酸沉淀剂沉淀mRNA

1. 按2:1的比例将微量核酸沉淀剂与mRNA溶液混合。微量核酸沉淀剂用前需要摇匀。

2. 室温15000 g离心10分钟(如果mRNA含量在2 ng以下,建议离心30分钟)。

3. 小心弃上清后,加入1 mL自备的75%乙醇,振荡混匀。

4. 15000 离心3-5分钟,小心弃上清。

5. 再短暂离心后小心吸弃上清,沉淀即为回收的mRNA沉淀,可溶于TE或RNA洗脱液中待用。