产品特点:
本产品是整合百奥莱博土壤DNA提取试剂盒(BTN60701)和柱式腐殖酸清除剂(BTN60801)两个产品而得的柱式升级产品。它结合了两者的优点,专门用于从各种土壤样品和河海沉积物中提取高质量的DNA的试剂。跟土壤DNAOUT相比它具有下列特点:
1. 去污染效果更好,得到的DNA可以直接作为PCR模板或酶切,不需要再进行去腐殖酸处理。
2. 操作过程更加简单快速,整个操作只需要10多分钟,扩容性好。
3. 产量高,每克土壤一般可以提取到5-50 ug DNA,片段长度在20-50 Kb,OD260/280一般都在1.8以上。
4. 适合于各种土壤(包括河海沉积物)。
常温运输及保存,保存期为一年。
使用方法:
1. 65℃预热溶液A,待其沉淀溶化后充分混匀,取0.5 mL加入到1.5 mL塑料离心管中并放置于65℃待用。
2. 称取0.1-0.3 g的土壤,加入到含预热溶液A的离心管中,震荡器上剧烈震荡5-10分钟。如果是扩量操作,可以使用更多土壤和较大离心管。也可以将同一种土壤在较大离心管中震荡处理,然后再分到1.5 mL离心管中。注意:不论使用大的还是小的离心管,一定要让管底的土壤震荡起来。
3. 将离心管置于65℃水浴中保温至少5分钟。
4. 12000-15000 g室温离心3分钟,将上清转移到一新离心管中(上清液一般呈淡黄色或深棕色,实际颜色取决于腐殖酸的含量,上清液的体积一般为300-400 μL)。
5. 在上清液中加入等体积的溶液B,上下颠倒30秒充分混匀,溶液将呈白色或
淡黄色混浊状。
6. 将离心管冰浴至少5分钟。
7. 12000-15000 g室温离心3分钟,转移上清到新的1.5 mL离心管中,上清液颜色将比第4步得到的上清的颜色稍淡,体积在0.7 mL左右。
注意:下面第8-第9步的氯仿抽提操作可以省略,直接进入第10步,但DNA的产量会低50%左右,OD260/280在1.7-1.8。如果直接进入第10步,则转移的溶液体积不要超过0.6 mL,否则没有空间加溶液C。
8. 加入0.2 mL的氯仿(自备),震荡器上充分振荡30秒混匀。注意:一定要让管底的溶液震荡起来。
9. 12000-15000 g室温离心3分钟,小心转移上清到新离心管中。说明:离心后两相交界面将有白色膜状物,其中有机相部分颜色较深,一般呈淡棕色。上清的颜色取决于土壤中腐殖酸的含量。将上清转移到新的1.5 mL离心管时,不要超过0.6 mL,否则没有空间加溶液C。如果有多余的可以弃之不用。
10. 加入1.5倍体积的溶液C,上下颠倒30秒混匀。
11. 分两次上柱(即先转移一半的混合液到离心吸附柱中,12000-15000 g室温离心半分钟,弃穿透液,然后再将剩下的混合液到离心吸附柱中,12000-15000 g室温离心半分钟,弃穿透液)。
12. 加0.7 mL通用洗柱液到离心吸附柱中,12000-15000 g室温离心半分钟,弃穿透液。
13. 如果有必要,可以再加0.3 mL通用洗柱液到离心吸附柱中,12000-15000 g室温离心半分钟,弃穿透液。增加一步洗涤能使得到的DNA的纯度稍有提高,但产量稍微有所降低。
14. 12000-15000 g室温再离心半分钟。此步十分重要,否则残留的通用洗柱液会污染DNA。
15. 将离心吸附柱转移到一新的1.5 mL塑料离心管中,加入50-100 uL DNA洗脱液2.0。
16. 室温放置离心吸附柱1-2分钟。
17. 12000-15000 g室温离心半分钟,离心管中溶液即为DNA样品,可以立即使用或存放于冰箱待用。