产品特点:
本试剂盒是结合植物叶绿体纯化试剂盒和柱式植物DNA抽提试剂盒而推出的新兴产品,专门用于植物叶绿体DNA的快速提取。它具有下列特点:
1. 纯度高,不含污染和抑制剂,可以直接用于酶切、PCR、real-time PCR、 multiplex PCR、RAPD、RFLP、AFLP、Southern Blotting, microsatellite analysis等各种后续分子生物学实验,不会发生离心柱堵塞现象。
2. 产率一般在1-2 ug/1 g叶片样品。OD260/280一般在1.8以上。DNA片段长度一般在40-50 Kb左右。
3. 本产品足够15次提取,每次可处理30g叶片。
4. 已经成功用于菠菜,大豆,莴笋,白菜,烟草和甜菜等双子叶植物,也适用于单子叶等其他植物(可能需要优化条件)。
常温运输,4℃保存, 保存期限一年
使用方法:
注意:叶绿体对温度高度敏感,所以整个操作必须在冰上或者在冷室进行,所用器皿和溶液均需要在4℃预冷。离心时一定要在4℃进行,离心力以g而不是rpm
计算。如果需要研究叶绿体的功能,提取还需要在昏暗的光线条件下进行。强烈建议用显微镜监控整个过程中叶绿体的回收情况。
一:叶绿体的纯化
1. 实验前1-2天将植物放在暗室培养以减少叶绿体中淀粉颗粒的形成,否则离心时这些颗粒很容易使叶绿体破裂。叶片在实验前需先用自来水洗净,再用蒸馏水淋洗,去掉多余水分。如果叶片采集后不能立即处理,则保存时需要保持叶片湿润,即使如此,叶片的放置时间也不能超过一天。
2. 新鲜(实验当天)制备匀浆液:将自备的去离子水与匀浆液成分一按4:1的比例混合,然后在混合液中加入匀浆液成分二干粉到终浓度0.1%(每100 mL中加入0.1 g干粉),摇晃溶解后所得溶液即为匀浆液,冰上预冷待用。实验(从30 g叶片提取叶绿体)所需要的匀浆液体积随材料不同而异。
3. 新鲜采集植物叶片,快速去除叶脉并将叶片剪成1-3 cm2大小的碎片并浸泡在适量的预冷的匀浆液中(每克叶片加4 mL匀浆液,但对烟草和大豆,每克叶片需要加6 mL匀浆液)。
4. 将浸泡了叶片的匀浆液转移到Waring匀浆机(即家用制备果汁的匀浆机)中,低速匀浆10秒,避免起泡沫。用玻璃棒把液面的碎片按入匀浆机底部后,再低速匀浆10秒。注意:除Waring匀浆机外,还可以选择Dounce玻璃匀浆器,Polytron匀浆机和研磨(加玻璃珠)等裂解细胞的方法,但这些方法的单次处理量都比较小,需分成很多小份单独匀浆,然后再汇集。
5. 用带柄尼龙滤膜过滤匀浆液,可先将滤液收集到预冷的200 mL量筒中,再等分到4个预冷的50 mL的塑料离心管中(每个管中的滤液不要超过35 mL)。带柄尼龙滤膜后可反复使用。
6. 在水平转子离心机上4℃ 200 g离心3分钟(对菠菜,白菜和莴笋材料)或400 g离心1分钟(对甜菜材料),白色沉淀为未破裂的细胞或细胞核。其他植物材料则需要用户自己摸索离心力。
7. 将上清液(含叶绿体)转移到一个新的、预冷的50 mL塑料离心管中。
8. 在水平转子离心机上4℃ 1000 g离心7分钟,小心弃上清,沉淀含叶绿体。
9. 在沉淀中加入1.5 mL预冷的匀浆液,手弹离心管底部使叶绿体重悬。注意:重悬时避免溶液起泡,也不要用枪头吹打,否则叶绿体容易破裂。沉淀下有白色淀粉属于正常现象,但重悬叶绿体时避免将白色淀粉重悬。
10. 将4管叶绿体重悬液汇集(共约6 mL),得到叶绿体粗提液,如果直接用于
叶绿体DNA纯化(容易有细胞核DNA污染),则在水平转子离心机上4℃ 1000 g离心7分钟,小心弃上清,沉淀为叶绿体,用于DNA纯化。
11. 如果需要无污染的叶绿体DNA,就需要用40% Percoll密度梯度离心法将完整的叶绿体和其他污染物进一步分离。具体操作步骤是:在50 mL塑料离心管中先加入6 mL匀浆液成分一和4 mL的Percoll,充分混合均匀得到40%的Percoll溶液。在其液面上小心铺上6mL的叶绿体粗提液。在水平转子离心机上4℃ 1700 g离心6分钟,管底绿色沉淀为完整的叶绿体,液面的绿色部分为破碎的叶绿体。小心将上清倒出后,用于叶绿体DNA纯化。
二:叶绿体DNA的纯化(溶液A和溶液B容易产生沉淀,溶液B十分粘稠,均需65℃溶解并摇匀后再使用)
12. 将600 uL预热的溶液A加入到叶绿体沉淀中后充分吹打混匀。
13. 加入300 uL 预热的溶液B,震荡混匀10-30秒。注意:溶液B非常粘稠,可以采取称量方法取用或将1 mL 枪头剪去一截再吸取。
14. 65℃放置3-5分钟。如果室温放置,DNA产量会降低10-20%。
15. 加入200 uL自备氯仿,震荡混匀10-30秒。
16. 12,000 rpm室温离心2分钟。此时上清液将变得透明,中间层有白膜。小心转移上清液(约0.8 mL)到一个新的3-5 mL离心管中,避免触及中间层的白膜,可留少量上清不取。
17. 加入1.5倍体积(约1.2 mL)的溶液C,颠倒混匀后先转移0.7 mL到离心吸附柱中,室温放置至少2分钟。12,000 rpm室温离心1分钟,DNA将吸附在离心吸附柱的膜上,倒弃收集管中的穿透液。
18. 再将剩余的溶液按上步方法上柱。
19. 将0.5 mL通用洗柱液加入到离心吸附柱中,12,000 rpm室温离心1分钟,弃穿透液。
20. 重复上步操作。空甩半分钟去除残留液体。
21. 将离心吸附柱放置在一新的1.5 mL塑料离心管中,加50-100 uL DNA洗脱液2.0,室温放置3-5分钟。
22. 12,000 rpm室温离心1分钟即得植物叶绿体DNA溶液。
23. 重复上步操作,直接取5-10 uL电泳检测,其余放冰箱备用。