产品特点:
第二代的非饱和型荧光染料(如SYBR Green I)在高浓度下会抑制荧光PCR,所以反应重复性很不稳定,并且不能用于要求严格的Tm 分析。本产品跟SYTO9、LC Green、EvaGreen 一样,是第三代饱和型荧光染料,在饱和浓度下也不抑制荧光PCR 反应,具有下列特点:
1. 饱和浓度不抑制PCR 反应,因此得到的荧光信号更强。
2. 抗水解、抗热解和抗光解的能力强于目前常用的SYBR Green I。
3. 饱和浓度下染料分子没有机会在DNA 分子间发生移位,因此荧光强度跟DNA变性程度呈线性关系,可以用于精细的Tm 测定实验,如High-resolution melting curve analysis 等。
4. 跟目前常用的PCR 仪器(包括iCycler、LightCycler、ABI 测序仪) 兼容。
激发和发射光谱跟FAM 和SYBR Green I 接近,可以使用SYBR Green I 的光学设置参数。
5. 不能渗透进入细胞内,毒性和致突变性远低于SYBR Green I。
6. 可以用于qPCR、高分辨DNA 溶解曲线分析(HRM、high-resolution DNA melt curve analysis)、毛细管电泳等研究。
常温运输、-20℃避光保存,有效期一年。
使用方法:
先将本产品放置在室温融化,然后震荡10 秒钟,短暂离心后待用。下面以50 uL的标准PCR 反应体系为例说明其使用:
1. 在一干净的PCR 管中,加入下列成分:
10 X PCR Buffer (No Mg2+) 5 uL
MgCl2 50 mM 2.5 uL
dNTP 10 mM 1 uL
本产品(PCR 级绿如蓝染料) 2.5 uL
Taq DNA 聚合酶1-5 U
DNA 模板适量
PCR 引物5-50 pmol each
补水到50 uL
2. 放入荧光PCR 仪中进行qPCR,并在退火或延长反应时记录荧光信号。使用
的光学参数可以跟FAM 或SYBR Green I 完全一样。
注意事项:
1. 如果使用iCycler,可以不加FAM;如果使用ABI 系统,需要在Well Inspector选项下的非特异参照中选择“无”;使用LightCycler 时,在PCR 体系中再加入终浓度为0.5 mg/mL 的BSA 以降低仪器对染料和模板的非特异吸附。
2. 如果使用化学修饰过的Taq DNA 聚合酶,可能需要减低KCl 的浓度并提高Tris 的浓度。